Visualization

Discovery Studio Visualizer

Молекулярная визуализация – ключевой аспект анализа и распространения исследований моделирования. Это позволяет визуализировать механистическое понимание структуры молекулы, так что ключевые идеи могут быть разделены между экспертами по вычислительному моделированию и членами совместной группы.

Визуализатор BIOVIA Discovery Studio – это бесплатное многофункциональное приложение для молекулярного моделирования для просмотра, обмена и анализа данных о белках и малых молекулах. Эксперты и их коллеги могут беспрепятственно и эффективно обмениваться результатами без потери времени или научной информации.

  • Визуализируйте и исследуйте очень большие системы макромолекул (например, рибосомы), используя широкий спектр типов отображения
  • Поддержка ряда стереографических опций (например, разделение экрана, аппаратное стерео)
  • Поддержка аппаратного ускорения графики для расширенных параметров визуализации, таких как определение глубины, размытие и затенение.

Молекулярная графика – не единственные результаты, которыми вы, возможно, захотите поделиться. Другие возможности визуализации включают:

  • Последовательности, включая поддержку представления цепи для многодоменных белков (например, антител)
  • 2D и 3D графики, гистограммы, тепловые карты и таблицы данных
  • Составьте карту взаимодействий, используя полный набор благоприятных, неблагоприятных и неудовлетворенных мониторов, не связанных с облигациями
  • Интерактивность между несколькими графическими представлениями одних и тех же данных

Визуализация – это больше, чем просто создание графической сцены; его цель – общаться и сотрудничать. С продуктами Discovery Studio вы можете сотрудничать с коллегами, используя раскадровки, чтобы:

  • Захватывайте, перемещайтесь, анимируйте и делитесь несколькими видами структур
  • Включите функции перехода между сценами, тайминга и автоматического воспроизведения

Визуализатор Discovery Studio предоставляет полный набор функций, позволяющих уловить конкретные нюансы вашего исследования:

  • Качественная графика с расширенными возможностями отображения и поддержкой стерео
  • Возможность генерировать изображения публикационного качества
  • Интерактивное трехмерное графическое представление со связанной иерархией и представлениями таблиц данных
  • Многосторонние поверхности и изоповерхности для улучшенной молекулярной визуализации
  • Возможность построения данных из нескольких рядов данных с помощью линейных и точечных графиков, трехмерных графиков и гистограмм.
  • Возможность построения графиков, включая тепловые карты, гистограммы, графики посещаемости и многое другое
  • Функциональность раскадровки для захвата серии молекулярных изображений для демонстрации и публикации
  • Экспорт раскадровки как фильмов
  • Функции сортировки, фильтрации и группировки, доступные для свойств в таблице данных
  • Создание сценариев Perl для автоматизации повторяющихся задач или связывания задач вместе для простоты использования
  • Панели инструментов, панели инструментов и макет интерфейса можно настроить по желанию
  • Поддержка большого количества форматов файлов структур и последовательностей
  • Расчеты RMS доступны на разных уровнях детализации
  • Доступны мониторы для широкого спектра благоприятных, неблагоприятных и неудовлетворенных взаимодействий, не связанных с облигациями.
  • Строители молекул пептидов и нуклеиновых кислот
  • Расчет доступности растворителя для выявления захороненных и открытых остатков
  • Функции построения графиков, в том числе Рамачандрана и контактные графики
  • Загружать белковые структуры прямо из базы данных PDB
  • Создавайте отчеты по белкам для обобщения данных в структурах белков
  • Создайте биологически активную единицу белка из его субъединиц.
  • Функциональность чистого белка для добавления недостающих боковых цепей, устранения беспорядка и стандартизации именования атомов
  • Улучшенное отображение последовательностей белков и нуклеиновых кислот, анализ их состава и сопоставлений
  • Наложение структур на основе связок, остатков и выравнивания последовательностей
  • Предсказание вторичной структуры белковых последовательностей
  • Окно аннотаций для просмотра и редактирования аннотаций последовательностей нуклеиновых кислот и белков.
  • Отображение и контурные рентгеновские карты электронной плотности
  • Основные инструменты для редактирования рентгеновских структур
  • Отбор образцов конформаций ротамера боковой цепи и анализ взаимодействия
  • Поверхности взаимодействия рецептор-лиганд, демонстрирующие гидрофобность, водородные связи, ароматичность и др.
  • Просмотр 2D-изображения молекул в таблице данных
  • Инструменты для создания эскизов новых малых молекул
  • Измените или создайте собственные трехмерные небольшие молекулы с помощью панели инструментов из предварительно определенных фрагментов.
  • Оптимизируйте геометрию построенных структур с помощью быстрого силового поля, подобного Дрейдингу.
  • Можно рассчитать основные молекулярные свойства, такие как молекулярная формула и молекулярная масса.
  • Наложение структур на основе молекулярного наложения с помощью выравнивания поля или привязок
  • Определение, отображение и редактирование сайтов связывания лигандов
  • Создание 2D графиков взаимодействия рецептор-лиганд
  • Анализируйте паттерны связывания лиганда между белком и связанными с ним лигандами
  • Создание запросов фармакофоров (катализаторов) вручную
Вопрос специалисту





      Запрос коммерческого предложения

      Согласен на обработку персональных данных. Политика конфиденциальности

      Сообщить об опечатке

      Текст, который будет отправлен нашим редакторам: