Pharmacophore

Создание препаратов

Связывающие взаимодействия белков и лигандов возникают из-за множества стерических и электрохимических факторов. Понимание этих взаимодействий может помочь исследователям быстрее выявлять многообещающих новых терапевтических кандидатов.

Фармакофоры отображают эти особенности в трехмерном пространстве, предоставляя простые средства для виртуального скрининга библиотек соединений, определения характеристик связывания существующих отведений и оптимизации их работы.

BIOVIA Discovery Studio использует набор инструментов CATALYST для моделирования и анализа фармакофоров, чтобы помочь в оценке терапевтических средств на малых молекулах с данными, структурированными по мишеням, или без них. Он поддерживает разработку новых лекарственных препаратов, многоцелевых лекарственных препаратов и профилирование деятельности для стимулирования исследований и разработок малых молекул.

  • Автоматически генерировать фармакофоры на основе доступных данных
    • Наборы активных лигандов
    • Сайты связывания рецепторов
    • Рецепторно-лигандные комплексы
  • Выполните тщательную проверку фармакофоров на основе наборов контрольных соединений с известной активностью.
  • Гипотезы могут включать
    • Геометрические запросы на основе признаков
    • Сходство формы
    • «Запрещенное» пространство
  • Выйдите за пределы ограничений классических алгоритмов выяснения фармакофоров, исследуя Ensemble Pharmacophores для очень больших / разнообразных наборов соединений с риском нескольких способов действия

Проведите надежные скрининговые исследования фармакофоров

  • Создание и поиск баз данных трехмерных конформаций
  • Рассмотрите и проанализируйте полное конформационное пространство ваших лигандов
  • Изучите нецелевую активность и перепрофилирование лекарств с помощью базы данных PharmaDB *

Discovery Studio теперь включает самую обширную базу данных для профилирования лигандов. Построенный на основе scPDB * и проверенный с его использованием, PharmaDB содержит примерно 240 000 фармакофорных моделей рецептор-лиганд.

Разработайте и охарактеризуйте свои лиганды и комбинаторные библиотеки

  • Перечислить библиотеки на основе реакции или ядра
  • Перечислить состояния ионизации, таутомеры и изомеры
  • Отфильтруйте плохих кандидатов с помощью нежелательных функциональных групп и правил Липинского и Вебера или ваших собственных критериев
  • Рассчитайте многочисленные физико-химические свойства и отпечатки пальцев
  • Оптимизация комбинаторных библиотек с помощью оптимизации Парето, анализа разнообразия и сходства
  • Инструменты кластеризации и 3D-визуализация с использованием анализа PCA
Вопрос специалисту





      Запрос коммерческого предложения

      Согласен на обработку персональных данных. Политика конфиденциальности

      Сообщить об опечатке

      Текст, который будет отправлен нашим редакторам: