Antibody Modeling

Антитела

Биотерапевтические препараты обладают рядом уникальных преимуществ по сравнению с низкомолекулярными лекарствами. Их повышенное сродство и избирательность позволили исследователям решать новые и сложные задачи.

Это привело к резкому увеличению количества проектов НИОКР, посвященных антителам и другим биологическим средствам лечения, таким как биспецифические препараты. Однако эти проекты также должны преодолевать аналогичные проблемы в области безопасности и фармакокинетики, с которыми сталкиваются небольшие молекулы, хотя и с другой точки зрения. Такие факторы, как высокая иммуногенность или низкая растворимость, могут убить развитие эффективного кандидата.

Моделирование и симуляция могут значительно продвинуть развитие этих новых классов терапевтических средств. Например, исследователи могут предсказать свойства состава антитела и предложить мутации для их быстрого и недорогого улучшения по сравнению с одними только лабораторными экспериментами.

С этой целью BIOVIA Discovery Studio предлагает богатый набор инструментов, помогающих руководствоваться разработкой биотерапевтических средств, позволяя командам оптимизировать работу кандидатов in silico и упростить их физическую работу.

  • Автоматизированный каскад моделирования для простого и быстрого создания высококачественных полноразмерных 3D-моделей антител, Fab или Fv-моделей из набора последовательностей цепей легких и тяжелых антител и тщательно подобранной базы данных шаблонов антител PDB
  • Полная поддержка часто используемых схем аннотации антител – IMGT, Chothia, Kabat и Honegger
  • Одновременно и независимо выполнять множественное выравнивание последовательностей тяжелых и легких цепей.
  • Дополнительные экспертные инструменты для идентификации шаблонных структур антител и построения высококачественных моделей гомологии
  • Способность создавать структуры биспецифических полноразмерных антител
  • Уточнение петель CDR с помощью шаблона, трансплантации петель или моделирования петель de novo
  • Выполните подробный анализ модели
  • Проведите прогнозирование термической или pH-мутационной стабильности и сродства связывания
  • Определите потенциально стабильные места дисульфидных мостиков
  • Выполните стыковку антитело-антиген с помощью ZDOCK для определения критических взаимодействующих остатков
    • Прогнозировать остаточные мутации для гуманизации антител без ущерба для стабильности или эффективности антител
    • Изучите конформационную гибкость с помощью явного моделирования молекулярной динамики (MD) на основе растворителей с использованием CHARMm или NAMD
  • Рассчитайте биофизические свойства, включая изоэлектрическую точку, растворимость, вязкость (SCM *) и склонность к агрегации (индекс развития – SAP *) для ранней оценки пригодности для разработки
  • Прогнозирование сайтов, подверженных посттрансляционным модификациям (PTM), с помощью поиска мотивов на основе последовательностей
Вопрос специалисту





      Запрос коммерческого предложения

      Согласен на обработку персональных данных. Политика конфиденциальности

      Сообщить об опечатке

      Текст, который будет отправлен нашим редакторам: